ケモインフォマティクス

本書では，化合物の化学構造やオミクスデータを情報解析する広い意味でのケモインフォマティクスに着目し，分子・材料設計や新規物質創製，創薬などの化学的な課題を解決するための統合的なアプローチを紹介し，解説している。

目次

1．ケモインフォマティクスの基本的な考え方
1.1　ケモインフォマティクスとは　
1.2　化合物の表現法　
　1.2.1　グラフ表現　
　1.2.2　文字列表現　
　1.2.3　記述子表現　
　1.2.4　化合物の命名法　
　1.2.5　その他の化合物の表記法　
1.3　化合物データ　
　1.3.1　基本的なデータの形状　
　1.3.2　データベース　
1.4　分子設計の指針と構造活性相関　
　1.4.1　構造活性相関の基本　
　1.4.2　活性に影響を与える化学構造　
　1.4.3　定量的構造活性相関と各種指標　
1.5　シミュレーション　
　1.5.1　ドッキングシミュレーション　
　1.5.2　量子化学計算　
1.6　機械学習　
　1.6.1　機械学習の分類　
　1.6.2　機械学習モデルの解釈性　
1.7　ケミカルスペース　

2．化合物・タンパク質間相互作用解析
2.1　化合物の標的タンパク質・オフターゲット予測　
　2.1.1　インシリコ創薬　
　2.1.2　薬のゲノムワイドなスクリーニングの枠組み　
　2.1.3　化合物の表現法　
　2.1.4　既知の化合物・タンパク質間相互作用　
　2.1.5　新たな化合物・タンパク質間相互作用の予測　
2.2　化合物の効能予測　
2.3　ドラッグリポジショニング　

3．化合物のオミクス解析
3.1　トランスクリプトーム解析　
　3.1.1　トランスクリプトームとは　
　3.1.2　化合物応答トランスクリプトーム　
　3.1.3　化合物の標的タンパク質・オフターゲット予測　
　3.1.4　化合物の標的タンパク質・オフターゲット予測の性能評価　
　3.1.5　疾患の治療候補薬の予測　
　3.1.6　欠損値の予測　
　3.1.7　欠損値補完の性能評価　
　3.1.8　疾患の治療候補薬の予測における欠損値補完の影響　
3.2　ディジーゾーム解析　
　3.2.1　疾患を特徴づける遺伝子発現データ　

ほか

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