揺らぎの中の遺伝情報　ソフトマターとしてのクロマチンと生命

生命の情報を担う「柔らかな物質」とは。情報ソフトマターであるクロマチンの構造・運動・機能と、三者が相互に連関し安定的に遺伝子活動を制御する仕組みに、実験・理論・シミュレーションから迫る。物理学と分子生物学の垣根を越えた画期的著作。

遺伝情報を担う「柔らかな物質」である、DNAとタンパク質の複合体＝クロマチン。その構造・運動・機能と、三者が相互に連関し安定的に遺伝子活動を制御する仕組みに、実験・理論・シミュレーションから迫る。分子生物学と物理学の垣根を越え、ミクロとメゾをつなぐ画期的著作。

目次

はしがき

第1章　物理学者からの問いかけ
　　1-1　遺伝情報を担う物質
　　1-2　残された半分の問い
　　1-3　情報ソフトマター

第2章　情報ソフトマターとしてのクロマチン
　　2-1　クロマチンの柔らかい情報処理
　　2-2　Hi-C 法で見るクロマチン構造
　　2-3　コンパートメント、ドメイン、そしてループ
　　2-4　ヌクレオソーム凝縮原理：顕微鏡で見るクロマチン構造
　　2-5　ループ押し出しか？ ループ捕獲か？
　　2-6　染色体配置はテリトリー型か？ ラブル型か？
　　2-7　クロマチンの階層構造

第3章　クロマチンは動いている
　　3-1　酵母細胞のゲノムシミュレーション
　　3-2　生細胞イメージング
　　3-3　クロマチンのアクティブな運動
　　3-4　ドメイン形成の理論：
　　　　　コヒーシン動的二量体によるループ捕獲仮説

第4章　クロマチンの動きがつくる階層構造
　　4-1　これまでの理論とその限界
　　4-2　粗視化されたクロマチン領域間の相互作用
　　4-3　動きの違いがもたらすクロマチン相分離
　　4-4　クロマチン相分離による階層構造の形成

第5章　生命のソフトな情報処理
　　5-1　転写ハブ，そして転写ファクトリー
　　5-2　ヒストン修飾とドメイン
　　5-3　遺伝子ネットワークの非線形ダイナミクス

ほか

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