実験医学　Ｖｏｌ．４３－Ｎｏ．１５（２０２５増刊）「構造生命科学ＡｌｐｈａＦｏｌｄ時代にどう活かす？　生命機能を解く、変える、創るための技術と研究戦略」

あらゆる生命科学研究者が構造データを活用できる時代が到来！AlphaFoldを含む最先端の構造予測AI，クライオEMやクライオETで構造データを取得し，タンパク質の機能解析・デザイン・創薬にどう活かすのか，豊富な事例とともに研究戦略を解説．

目次

【目次】
序にかえて　構造を解く時代から活かす時代へ
ガイダンス　構造データの使い方

第1章　タンパク質構造を視る・知る
Ｉ．実験構造決定
1. 遺伝子発現制御におけるクロマチン構造のダイナミクス
2. RNAポリメラーゼＩＩ複合体による転写のメカニズム：高次複合体化により発揮される多彩な機能
3. クライオ電子顕微鏡による回転型ATPaseの構造機能解析
4. 感染受容体NTCPを介したB型肝炎ウイルス接着機構
5. クライオ電子線トモグラフィー解析へのAlphaFoldの応用
他

ＩＩ．in silico解析
8. AlphaFoldを活用したタンパク質複合体構造予測
9. AlphaFoldを活用した構造ダイナミクス解析：マグネシウム輸送体を例に
10. AlphaFoldによる複合体同定と受精機構の解明
11. AlphaFold Multimerを用いたユビキチン様タンパク質の複合体構造予測と機能の解明
12. cDNA display proteolysis法によるタンパク質構造安定性のメガスケール解析
他

第2章　タンパク質を創る（分子エンジニアリング）
Ｉ．自然界のタンパク質改変
1. 網羅的変異体解析と構造解析を組合わせたCasタンパク質の機能改変
2. ブリッジリコンビナーゼの発見から応用まで
3. チャネルロドプシンが有するK＋選択性の構造基盤
4. 構造解析と1分子観察を活用したプラスチック分解酵素PETaseの改良

ＩＩ．自然界に存在しないタンパク質のデザイン
5. 物理化学と経験的ルールに基づくde novoデザイン
6. 深層学習でゼロからつくる機能性タンパク質

第3章　タンパク質に結合する分子を創る（創薬）
1. 深層学習によるCPI予測の現状と展望
2. 創薬を加速する立体構造解析：中外製薬におけるクライオ電子顕微鏡の実装とその先
3. 構造ベース農薬開発の新展開
ほか

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