達人直伝マイクロバイオーム研究実践プロトコール　サンプル調製やデータ解析で陥りがちなピットフォールを攻略し、ヒト微生物叢の本来の姿を捉える

サンプル調製やデータ解析で陥りがちなピットフォールを攻略し、ヒト微生物叢の本来の姿を捉える。

あなたの扱うマイクロバイオームデータ，正しく取得，解釈できていますか？ 対象が複雑ゆえに多い研究の落とし穴を，“達人”たちが徹底フォローします．腸内細菌叢を軸に，真菌・ファージの解析や，皮膚・口腔などの微生物叢の解析まで網羅．実験の戦略や起こりうる問題への対処法を詳述し，ヒトのデータと結びつける方法も紹介しています．確かな知見を導き出すための必携書

目次

【目次】
序

1章　マイクロバイオーム研究をはじめる前に考えること
1　ヒトマイクロバイオーム研究の全体像
2　データベースの意義とその整備
3　細菌の分類と命名

2章　腸内微生物叢のマイクロバイオームデータの生産
1　微生物叢DNAの抽出技術の開発状況および酵素法プロトコール
2　腸内細菌叢DNAの抽出技術（ビーズ法プロトコール）およびライブラリ調製
3　腸内細菌叢を対象とした16SrRNA遺伝子のアンプリコンとメタゲノムの情報解析
4　腸内常在性ファージの解析・宿主細菌との相互作用
5　腸内環境の代謝オミクス分析・解析
6　腸内真菌叢のマイクロバイオーム解析

3章　その他の微生物叢のマイクロバイオームデータの生産
1　皮膚細菌叢のマイクロバイオーム解析
2　唾液微生物叢のショットガンメタゲノム解析
3　ロングリードを用いたヒトマイクロバイオームの染色体外エレメントの解析
4　古代サンプルのマイクロバイオーム解析

4章　細菌株の性質の解析
1　菌株単離・培養と選定・釣菌，保存

5章　マイクロバイオームデータの関連解析
1　ヒト遺伝子一塩基多型（SNP）とマイクロバイオームの関連解析
2　環境因子（食事，生活習慣，薬剤）や疾患とヒトマイクロバイオームの関連解析

達人への一歩
１定期的な精度管理を，その1
２定期的な精度管理を，その2
３定期的な精度管理を，その3
４ウイルス（ファージ）叢の構成比について
５メタゲノムデータのなかから真核生物由来のDNAを検出する手法
６古代DNA解析への道のり

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