独習Ｐｙｔｈｏｎバイオ情報解析　生成ＡＩ時代に活きるＪｕｐｙｔｅｒ、ＮｕｍＰｙ、ｐａｎｄａｓ、Ｍａｔｐｌｏｔｌｉｂ、Ｓｃａｎｐｙの基礎を身につけ、シングルセル、ＲＮＡ－Ｓｅｑデータ解析を自分の手で「改訂」

Ｐｙｔｈｏｎの定番テキストが待望の改訂！大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なＰｙｔｈｏｎの使い方から、シングルセル、ＲＮＡ－ｓｅｑ解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます。サンプルデータとコード見本付きで、今日から実践しながら学べます。改訂では、生成ＡＩの活用方法やＳｃａｎｐｙの詳細な解説を加筆し、各種ライブラリのアップデートに対応しました。

Pythonの定番テキストが待望の改訂！大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から，シングルセル，RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます．サンプルデータとコード見本付きで，今日から実践しながら学べます．改訂では，生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し，各種ライブラリのアップデートに対応しました．

目次

【目次】
改訂にあたり
はじめに（初版）

第1章 この本の使い方と事前準備
第2章 生成AIを用いたプログラミング
第3章 Jupyter Notebookの使い方
第4章 Python速習コース
第5章 文字列処理の基本 〜ファイルの読み書き，正規表現
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 〜オブジェクト指向入門
第7章 pandasはじめの一歩 〜表形式データの扱い方
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 〜pandas実践編
第9章 データの可視化 〜Matplotlib，Seabornを用いたグラフ作成
第10章 統計的仮説検定 〜RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで
第11章 シングルセル解析（１） 〜テーブルデータの前処理
第12章 シングルセル解析（２） 〜次元削減
第13章 シングルセル解析（３） 〜クラスタリング

付録A NumPy入門
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析

索引
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