生態遺伝学入門

野外で多様な生物を観察すると「この違いはどうやって生じたのだろうか？」「この違いに何か意味はあるのであろうか？」「これらは別種なのか、同種なのか？」「オスとメスは、どうしてこんなに違うのか？」などといった疑問がふつふつと湧いてくるであろう。本書は、こうした学生や研究者たちからの疑問に応えるために、生態遺伝学の重要なポイントをできるだけ平易に説明することを目指した入門書である。また、ここ１０年ほどの間に、次世代シークエンサーの開発によって野生生物のシークエンス解析が容易になり、集団遺伝学と進化生態学が急速に融合してきた。このような急展開を遂げつつある生態遺伝学の分野をカバーする唯一のテキストとなる。

野外で多様な生物を観察すると「この違いはどうやって生じたのだろうか？」「この違いに何か意味はあるのであろうか？」「これらは別種なのか，同種なのか？」「オスとメスは，どうしてこんなに違うのか？」などといった疑問がふつふつと湧いてくるであろう．

　本書は，こうした学生や研究者たちからの要望に応えるために，生態遺伝学の重要なポイントをできるだけ平易に説明することを目指した入門書である．

　また，ここ10 年ほどの間に，次世代シークエンサーの開発によって野生生物のシークエンス解析が容易になり，集団遺伝学と進化生態学が急速に融合してきた．このような急展開を遂げつつある生態遺伝学の分野をカバーする唯一の教科書となる．

目次

第1 章　生態遺伝学のための集団遺伝学入門
　1.1　2 つの遺伝モデル：集団遺伝と量的遺伝
　1.2　突然変異
　1.3　移住（遺伝子流動）
　1.4　選　択
　1.5　遺伝的浮動
　BOX 1：分子進化の中立説とほぼ中立説

第2 章　量的遺伝学入門
　2.1　狭義の遺伝率と育種家方程式
　2.2　選択勾配
　2.3　遺伝的相関による進化のバイアス
　BOX 2：育種家方程式と選択勾配の関係

第3 章　適応進化の遺伝基盤：表現型から迫る
　3.1　適応・適応度とは？
　3.2　適応形質を見つける
　3.3　適応形質の遺伝基盤を探る手法：QTL マッピング
　3.4　適応形質の遺伝基盤を探る手法：GWAS
　3.5　原因遺伝子座を絞り込めると選択係数（s）を計算できる
　3.6　フィッシャーの幾何学モデル
　BOX 3.1：選択勾配
　BOX 3.2：野生生物における選択勾配β
　BOX 3.3： QTL マッピングやGWAS に用いる個体数やマーカー数は？
　カラム：サン・マルコ聖堂のスパンドレル

第4 章　適応進化の遺伝基盤：ゲノムから迫る
　4.1　ゲノム配列から選択の痕跡を探る
　4.2　選択的一掃
　4.3　連鎖不平衡
　4.4　遺伝子系図とアリル頻度スペクトラム
　4.5　遺伝的多様性の尺度πとS
　4.6　コアレセント理論
　4.7　Tajima’s D
　4.8　どのくらい前の選択的一掃まで解析可能なのか
　BOX 4：コアレセント理論を用いた集団履歴解析

第5 章　適応進化の分子機構
　5.1　遺伝基盤とは？
　5.2　原因変異の特定と解析
　5.3　どういった突然変異が重要か？
　5.4　収斂進化の遺伝基盤と予測可能性
　カラム：「 決定論と偶発性」グールドの生命のテープのリプレイ思考実験

第6 章　種分化の定義および内因性雑種異常の遺伝基盤
　6.1　種分化の定義
　6.2　種分化の遺伝基盤に迫るアプローチ
　6.3　ドブジャンスキー・マラー不適合

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