ゲノム進化学

本書は、2007年刊行の『ゲノム進化学入門』を大幅に拡充し、2018年刊行の”Introduction to Evolutionary Genomics”ーSpringer社ーに書かれている内容およびそれ以降の研究の進展を書きこんでアップデートな内容にしたものです。
　３部構成となっており、第１部「進化は生物学を統合する」は、DNAからゲノムへ、DNAからタンパク質へ、生物界の階層構造、生命の歴誌の４章を含みます。第２部「ゲノム進化のメカニズム」では、突然変異、系統樹、集団の遺伝、ゲノムの長期進化を論じます。第３部「ゲノム進化の研究法」では、ゲノム配列の決定とデータベースの利用、整列と置換数の推定、系統関係の復元、集団進化史の解析、そして最後にゲノムと表現型をつなぐというゲノム進化研究の諸方法について解説しています。
　著者は学生時代から一貫して分子進化学、その後はゲノム進化学の研究をてがけてきました。大学院時代に開発した系統樹作成法のひとつである近隣結合法は、現在でも世界中で広く使われています。また最近終了した「ヤポネシアゲノム」プロジェクトでは、50名前後の研究者が日本列島人（ヤポネシア人）の起源と成立について様々な視点から研究をおこなったものですが、著者はその領域代表でした。これら最新の研究成果についても、本書には盛り込まれています。

目次

はじめに

第I部　進化は生物学を統合する

第１章　DNA からゲノムへ
1.1　DNA
1.2　遺伝子
1.3　ゲノム

第２章　DNA からタンパク質へ
2.1　DNA からRNA への転写
2.2　アミノ酸配列への翻訳と遺伝暗号
2.3　遺伝子発現のコントロール
2.4　タンパク質
2.5　タンパク質の多様性
2.6　酵素

第３章　生物界の階層構造
3.1　分子
3.2　細胞
3.3　組織
3.4　器官
3.5　個体
3.6　集団と種
3.7　生態系

第４章　生命の歴誌
4.1　宇宙のはじまりから考える
4.2　塩基配列とアミノ酸配列をつなぐ翻訳システムの進化
4.3　遺伝暗号の進化
4.4　DNA 複製の進化
4.5　代謝ネットワークの進化
4.6　原核生物の誕生とその多様化
4.7　真核生物の誕生
4.8　植物の誕生と多様化
4.9　菌類の誕生と多様化
4.10　動物の誕生と多様化
4.11　脊椎動物の誕生と多様化
4.12　哺乳類の誕生と多様化
4.13　霊長類の進化

第ＩＩ部　ゲノム進化のメカニズム

第５章　突然変異
5.1　突然変異の種類
5.2　塩基置換
5.3　挿入・欠失の突然変異
5.4　直列配列（いわゆるマイクロサテライト）の単位数の変化
5.5　遺伝子変換と組換え
5.6　遺伝子重複
5.7　多様な突然変異率
5.8　突然変異率の推定

第６章　系統樹
6.1　さまざまな系統樹
6.2　遺伝子系統樹
6.3　種系統樹
6.4　系統樹の基礎概念
6.5　系統樹と生物分類
6.6　系統樹では表現できない現象と系統ネットワーク

第７章　集団の遺伝
7.1　「集団」とは？
7.2　分枝過程
7.3　合祖過程
7.4　遺伝的浮動
7.5　集団の有効な大きさ
7.6　分集団構造と遺伝子交流
7.7　淘汰

第８章　ゲノムの長　ほか

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