メタゲノムデータ解析　１６Ｓも！ショットガンも！ロングリードも！菌叢解析が得意になる凄技レシピ

医学・生物学の研究や創薬などの産業応用に役立つメタゲノムデータの解析法を，料理のレシピ本のようにわかりやすく解説．共生菌も環境微生物も，菌叢の組成も機能も，ＰＣひとつでＬｅｔ’ｓ　ｃｏｏｋ！

医学・生物学の研究や創薬などの産業応用に役立つメタゲノムデータの解析法を，料理のレシピ本のようにわかりやすく解説．共生菌も環境微生物も，菌叢の組成も機能も，PCひとつでLet's cook！

※お届け日が変更になりました
11月30日→12月2日

目次

Chapter 1 メタゲノムデータ解析に必要なコンピュータリテラシー
レシピの例…
・Dockerで安定的にツールを実行できる仮想環境を構築する
・解析ごとに必要な演算能力にあわせてクラウドを活用する

Chapter 2 細菌叢の組成を調べる― ―16Sアンプリコン解析
レシピの例…
・QIIME2で系統組成、占有率、多様性を解析する
・公共データの系統組成をウェブツールで手軽に可視化する

Chapter 3 細菌叢の機能にまでふみこむ― ―ショットガン解析
レシピの例…
・MAG（Metagenome-Assembled Genome）を構築し種レベルの系統組成を解析する
・機能アノテーションを行い系統組成の生物学的意義を考察する

Chapter 4 解析したデータを共有・利用する
レシピの例…
・論文投稿のためNGSデータを登録する
・特定のキーワードで公共データを横断検索する

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