バイオインフォマティクスデータスキル オープンソースツールを使ったロバストで再現性のある研究
- ページ数
- 528p
- ISBN
- 978-4-87311-863-5
- 著者情報
- バッファロー,ヴィンス(バッファロー,ヴィンス)(Buffalo,Vince)
オレゴン大学のAndrew Kern教授とPeter L.Ralph教授の研究室に所属する博士研究員、専攻は進化遺伝学。博士課程(集団遺伝学)はカリフォルニア大学デービス校(UC Davis)、Graham Coop教授の研究室に所属。同校ゲノムセンターのバイオインフォマティクスコアおよび植物科学科でバイオインフォマティシャンの専門家として働いていた。10代の頃からプログラマとしての能力を大いに発揮し、ゲノムの統計解析に熱中した。仕事中、プライベートの時間を問わず、オープンソースのバイオインフォマティクスツールの開発に取り組む
片山 俊明(カタヤマ トシアキ)
博士(科学)。情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター特任准教授。専門は、バイオインフォマティクス、データベース。生命科学研究を効率化するオープンソースの技術開発と標準化に取り組んでいる
川島 秀一(カワシマ シュウイチ)
博士(科学)。情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター特任准教授。専門は、バイオインフォマティクス、セマンティックウェブ等。生命科学の知識を、計算機を用いて効率よく利用できる環境構築に取り組んでいる
鈴木 治夫(スズキ ハルオ)
博士(学術)。慶應義塾大学環境情報学部准教授。専門は、バイオインフォマティクス、ゲノム微生物学。都市環境の微生物群集、薬剤耐性、可動性遺伝因子(プラスミド)の多様性に関する研究に取り組んでいる
山本 泰智(ヤマモト ヤスノリ)
博士(情報理工学)。情報・システム研究機構ライフサイエンス統合データベースセンター准教授。専門は、テキストマイニング、セマンティックウェブ、バイオインフォマティクス。生命科学のデータをより使いやすくするために日々研究・開発に取り組んでいる
セブン-イレブン受取り(送料無料)
発送目安
発売日(発売日以降は当日)~2日で発送
宅配(送料¥550税込)
発送目安
発売日(発売日以降は当日)~2日で発送
交通状況・天候の影響や注文が集中した場合等、お届けにお時間をいただく場合がございます。
商品説明
バイオインフォマティクス(生命情報科学)とは、コンピュータによる情報解析の手法を生物学の問題に応用する学問のことを指します。本書は、基本的なプログラミングに関する知識を持ったバイオ研究者を対象に、“ロバストで再現性のある研究”のため、複雑で大規模な配列データから意味を抽出し、探索するための技術を解説します。データを処理する方法としてPython、R、Gitなどのオープンソースツールを用いるため、次世代のデータにも適用できます。三部構成となっており、第1部ではバイオインフォマティクスの根本的な考え方や学び方、第2部ではプロジェクトを始めるための基本的スキル、第3部では実践編としてツールを使ってどのようにデータを処理するかを学ぶことができます。近年、ニーズが高まりつつあるバイオ分野において不可欠なデータ処理技術のすべてがこの一冊に詰まっています。
ニーズの高まるバイオ分野に不可欠なデータ処理技術のすべて!
本書は、基本的なプログラミングに関する知識を持ったバイオ研究者を対象に、Python、R、Gitなどのツールを使ってバイオ系のデータを処理する方法について解説する書籍です。バイオインフォマティクス(生命情報科学)とは、コンピュータによる情報解析の手法を生物学の問題に応用する学問のことを指します。本書では、Python、R、Gitなどのオープンソースのツールを利用して、複雑で大規模な配列データから、意味を抽出し、探索するための技術を解説しています。
目次
第1部 基本方針:ロバストで再現性のあるバイオインフォマティクスのためのデータスキル(バイオインフォマティクスの学習方法)
第2部 前提条件:バイオインフォマティスクプロジェクトを開始するための必須スキル(バイオインフォマティクスプロジェクトの準備と管理
Unixシェル再入門
リモートマシンで作業する
科学者のためのGit
バイオインフォマティクスのデータ)
第3部 実践:バイオインフォマティクスのデータスキル(Unixツール
R言語入門
範囲データの操作
配列データの操作
アラインメントデータの操作
シェルスクリプト作成、パイプラインの記述、タスクの並列化
TabixとSQLite:メモリを使わないアプローチ
おわりに)
商品詳細
- 出版社名
- オライリー・ジャパン
- サイズ
- 24cm
- 対象年齢
- 一般
- フォーマット
- 単行本
- 原題
- 原タイトル:Bioinformatics Data Skills
注意事項
- 本の帯に関して
- 帯つきでの出荷はお約束しておりません。
商品ページに、帯のみに付与される特典物等の表記がある場合でも、確実に帯つきでの出荷はお約束しておりません。
また、帯は商品の一部ではなく「広告扱い」のため、帯の有無・破損による交換や返品は承っておりません。 - 版・表紙について
- 版・表紙(カバー)のご指定は承っておりません。ご注文いただくタイミングによっては、お届けする商品の版や表紙が商品ページ上のものとは異なる場合がございます。
また、初版にのみにお付けしている特典(初回特典、初回仕様特典)がある商品は、商品ページに特典の表記がされている場合でも、無くなり次第終了となります。